Fondements génomiques des effets interactifs de l’introgression en aquaculture et du changement climatique sur l’adaptation locale du saumon atlantique

Les poissons échappés d’élevages aquacoles peuvent introduire des gènes domestiques chez le saumon atlantique sauvage, ce qui réduit la diversité génétique adaptée aux conditions locales et risque d’affaiblir la capacité des populations à faire face au changement climatique ; ces deux menaces sont susceptibles de se conjuguer pour accélérer le déclin des populations. Ce projet utilisera la génomique temporelle pour suivre les changements dans les allèles associés au climat et à la domestication chez le saumon atlantique du Nord-Ouest, en comparant des échantillons historiques de la rivière Saint-Jean, des souches aquacoles contemporaines et des populations sauvages présentant différents niveaux d’introgression, afin d’identifier les signatures génomiques de la domestication, de l’introgression et de la sélection induite par le climat. En identifiant les loci liés à l’adaptation au climat et en modélisant les risques futurs, l’étude vise à éclairer les stratégies de gestion visant à protéger la résilience évolutive du saumon sauvage.